Ignalinos rajono Vidiškių gimnazija pradėta statyti 1988 metais.  1992 m. rugsėjo 1 dieną ji duris mokiniams atvėrė kaip devynmetė bendrojo lavinimo mokykla.1995 metų rudenį mokykla tapo vidurine.

Po 2006 metų balandį vykusios vidurinio ugdymo programos akreditacijos 2006 m. rugsėjo 1 d. Ignalinos rajono savivaldybės Tarybos sprendimu Ignalinos r. Vidiškių vidurinė mokykla tapo gimnazija.  Nuo 2009 m. rugpjūčio 31 d. prie gimnazijos prisijungė 4 skyriai: Kazitiškio ir Mielagėnų (anksčiau buvę savarankiškos pagrindinės mokyklos) bei Bernotų ir Švedriškės (anksčiau buvę kitų mokyklų pradinio ugdymo skyriai). Nuo 2009 m. rugsėjo mėn., nesusirinkus pakankamam mokinių skaičiui, nutraukta Švedriškės skyriaus veikla.

      2009-09-01 duomenimis, gimnazijoje mokosi 337 mokiniai. Iš jų: 206 pačioje gimnazijoje, 11 Bernotų skyriuje, 70 Kazitiškio skyriuje ir 50 Mielagėnų skyriuje. Dar 7 vaikai lanko priešmokyklinio ugdymo grupę Kazitiškio skyriuje.Gimnazijoje dirba 31 mokytojas (5 mokytojai metodininkai, 17 vyresniųjų mokytojų), Kazitiškio skyriuje – 19 mokytojų (4 mokytojai metodininkai, 5 vyresnieji mokytojai), Mielagėnų skyriuje – 15 mokytojų (2 mokytojai metodininkai, 3 vyresnieji mokytojai), Bernotų skyriuje dirba viena pradinių klasių mokytoja. Mokinių socializacijos problemas gimnazijoje ir skyriuose sprendžia trys socialiniai pedagogai, vyr. specialusis pedagogas-logopedas, dirba vaikų slaugytojos.  
 
Plačiau apie gimnazijos veiklą skaitykite interneto svetainėje www.vidiskiu.ignalina.lm.lt